需要与原发性三叉神经痛鉴别的疾病有：

　　(1)继发性三叉神经痛：是指由于肿瘤压迫、炎症、血管畸形引起的三叉神经痛。常表现为三叉神经麻痹并持续性疼痛(面部感觉减退、角膜反射迟钝等)，常合并其他脑神经麻痹，可由多发性硬化、延髓空洞症、原发性或转移性颅底肿瘤所致。做头部CT和MRI可做出鉴别。

　　继发性的三叉神经痛的病因有：①异位动脉或静脉、动静脉畸形、动脉瘤对三叉神经根的压迫、扭转。②桥小脑角或半月节部位的肿瘤，前者多为胆脂瘤，听神经瘤，脑膜瘤，其次三叉神经纤维瘤，颈静脉孔神经鞘瘤，血管性肿瘤等；后者如半月神经纤维瘤，神经母细胞瘤，麦氏窝脑膜瘤等。③蛛网膜炎所致粘连、增厚。④颅骨畸形，包括寰枕畸形。⑤颅有肿瘤，纤维结构不良。⑥鼻咽癌颅内转移。⑦多发性硬化。

　　(2)一般牙痛：呈持续性钝痛，多局限于牙龈部、进冷、热食物可加剧，局部和X线检查有助鉴别。医界流传“全美国一年有一万颗牙齿，因三叉神经痛被误诊而拔除”的说法，说明医生常把三叉神经痛误诊为牙痛。三叉神经从脑内延伸出来后分成三支，第一支管理一侧额部、眼部区域的感觉，第二支和第三支分别管理下眼睑、鼻旁、上下嘴唇以及上下两排牙齿区域的感觉。如果哪一支患病，就会出现相应部位的疼痛，尤以第二、三支发病最多见，所以患者往往感觉一侧的牙齿剧烈疼痛，常常误诊为牙痛。尽管拔除了“有病”的牙齿，但神经依然存在，因此疼痛不会消除。三叉神经痛一旦出现往往反复发作，疼痛剧烈难忍，严重影响患者的健康、生活和工作。

　　(3)鼻窦炎：为局部持续性钝痛，局部有压痛，可有发热、白细胞增多、流脓涕等炎症表现，鼻腔检查及X线摄片可确诊。

　　(4)颞颌关节病：主要为咀嚼时疼痛而运动受限，局部有压痛。

　　(5)非典型面痛：发生于忧郁和神经质的患者，疼痛模糊不定，通常为两侧，情绪是唯一加重痛的因素，但无触痛点。

　　(6)需与其他面部疼痛，如舌咽神经痛相鉴别。