“从广泛意义上讲,就是对细胞的行为和决策进行控制,让其对任何感兴趣的蛋白质作出反应。”负责该项研究的加利福尼亚斯坦福大学生物工程师克里斯蒂娜·斯莫克说,其主要难点在于如何控制细胞行为,以及如何开发细胞路径。
为此,研究小组制造了一段DNA(脱氧核糖核酸)作为基因线路,将其插入细胞转录到RNA(核糖核酸)中后,它会去探寻细胞内部是否存在某种特殊的目标蛋白质,一旦找到,线路就会给这种蛋白质编码。
比如,其中一种线路包含了一种酶的基因,这种酶能让细胞对抗病毒药物更昔洛韦(ganciclovir)更加敏感。研究人员在基因序列中插入一个停止信号,以防止细胞通过信使RNA生成工作蛋白质,而到下一个停止信号时,它们会编码一小段RNA作为一个适配子,识别一种叫做beta-联蛋白的信号蛋白质(在某些肿瘤中beta-联蛋白会被过度复制),找到目标后适配子就会与其结合,由此会让细胞与信使DNA以某种方式铰接,从而清除停止信号以产生酶。
为了检验设计线路的效果,他们激活人体细胞产生额外的beta-联蛋白,让它们变得像癌细胞,然后用更昔洛韦来治疗,结果显示,含有编制线路的细胞都被药物杀死了。
斯莫克说,一条线路里有多个适配子感受器,能对不同类型的蛋白质起不同的反应。从理论上,这种线路能包含任何基因,也可以设计适配子来识别任何蛋白质。通过扭转这种线路里的“线”,能让细胞不仅对存在的蛋白质发生响应,还能对缺失的蛋白质发生响应。
加利福尼亚劳伦斯·伯克利国家实验室的系统与合成生物学家亚当·阿金说,新技术在灵活性上是一种突破。在利用细胞信号方面,其他研究倾向于作为一种“一次性的预设工程”(one-offs of bespoke engineering),而斯莫克的线路可以用在不同类型的细胞中,开发更为广泛的生物路径。
斯莫克认为,这种“细胞黑客”线路(Cell-hacking circuit)要进入临床应用还需再等几年,但与其他实验性治疗相结合,他们最终将能够控制其在体内发挥作用时的位置和时机。比如,通过指示多功能干细胞对体内的蛋白质踪迹信号发生响应,让它们生出多种组织,分化成希望的样子;或让含有特定线路的杀癌免疫细胞能免受健康细胞的攻击。
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